產(chǎn)品名稱:NGS Fast Ligation Module
中文名稱:NGS 快速連接模塊
產(chǎn)品編號與包裝規(guī)格:
編號 | 產(chǎn)品名稱 | 規(guī)格 | 產(chǎn)品介紹 | 價格 |
HKM066A | NGS Fast Ligation Module | 24次/盒 | 預(yù)混酶模塊(NGS 快速連接) | 2745 |
產(chǎn)品描述:
NGS Fast Ligation module 是專門針對于 illumina 高通量測序平臺所優(yōu)化的預(yù)混酶模塊。使用本模塊可以將 3'端 帶有 dA 尾的 DNA 片段與 adapter 進(jìn)行快速連接。與常規(guī)方法比較,本模塊采用了一步法反應(yīng)流程,NGS DNA Fragmentation/End Repair/dA-Tailing Module 或 NGS DNA End Repair/dA-Tailing Module 反應(yīng)后所獲得的片段后 DNA,無需磁珠純化,可使用本模塊直接與 adapter 進(jìn)行連接,省去了多步磁珠純化步驟,操作更加簡便,文庫轉(zhuǎn) 化效率更高。
適用范圍:將 DNA adapter 與 3'端添加 dA 的 DNA 文庫片段的快速連接(如 NGS DNA Fragmentation Module 和 EndRepair/dA-tailing Module 處理后的產(chǎn)物)。
適用樣本量:1ng -1μg DNA。
產(chǎn)品特點:
1) 無需磁珠純化,可直接將 DNA adapter 與帶有 dA-Tailing 的 DNA 片段連接;
2) 連接效率高,可進(jìn)行微量樣本的 DNA adapter 連接。
注意事項:
1、開始實驗前,對 DNA 濃度精確定量至關(guān)重要,推薦 DNA 上樣量為 1ng-1μg。DNA可溶解于去離子水、10 mM Tris Buffer EB 或 0.1×TE 等。
2、推薦 DNA 的上樣量指的是片段化后的 dsDNA 的量。推薦 使用 Qubit、Picogreen 或者其他染料法對 DNA 濃度進(jìn)行精確定 量。
3、請確認(rèn) DNA 溶液中不含陽離子及螯合劑,如果 DNA 溶解 于 1×TE 或不確定 DNA 溶液中的 EDTA 濃度,需先對 DNA 進(jìn)行純化后再進(jìn)行片段化反應(yīng)。
保存條件:-20℃保存,盡量避免反復(fù)凍融。
NGS Fast Ligation Module 產(chǎn)品組成:
A 包裝(24 次) | B 包裝(96 次) | |
Adapter-ligation Enzyme | 120μl | 480μl |
Adapter-ligation Buffer | 1ml×2 | 1ml×5 |
RNase Free Water | 1ml | 1ml×2 |
操作步驟:
1,根據(jù)經(jīng) NGS DNA Fragmentation Module 和 End Repair/dA-Tailing Module 處理后的產(chǎn)物的量,計算使用接頭 的量并按照下表對接頭濃度進(jìn)行稀釋:
起始樣本量 Adapter | 稀釋倍數(shù) | 稀釋后 Adapter |
100ng<X≤1μg | 不稀釋 | 10μM |
25ng<X≤100ng | 稀釋 2 倍 | 5μM |
5ng<X≤25ng | 稀釋 10 倍 | 1μM |
1ng<X≤5ng | 稀釋 25 倍 | 0.4μM |
2,按照下表所示各組分用量配制反應(yīng)體系,并將配制完成的反應(yīng)體系輕柔混勻后置于冰上
名稱 | 體積 |
dA-tailed DNA | 40μl |
Adapter -Ligation Buffer | 50μl* |
Adapter -Ligation Enzyme | 5μl |
DNA Adapter | 5μl** |
Total volume | 100μl |
注:* Adapter -Ligation Buffer 長時間放置會有白色沉淀,用前請上下顛倒、振蕩,使液體中白色沉淀充分溶 解并瞬時離心后使用。
**本公司接頭濃度為 10μM,請根據(jù)片段化 dsDNA 量對接頭進(jìn)行稀釋,加水補齊,使接頭體積為 5μl。
3,將此配制好的 100μl連接反應(yīng)液輕柔吸打混勻,置于 PCR 儀中,反應(yīng)程序如下:
溫度 | 時間 |
熱蓋 105℃ | off |
16℃ | 15min |
4℃ | Hold |
注:當(dāng)片段化 dsDNA 量較低,實驗效果不理想時,可嘗試將連接時間延長一倍。
4,連接產(chǎn)物磁珠純化(Post Ligation Clean Up) 該步驟使用磁珠對連接產(chǎn)物進(jìn)行純化或分選。純化可除去未連 接的 Adapter 或 Adapter Dimer 等無效產(chǎn)物。